Use el Prompt para ingresar los datos a las variables de las edades y de esa manera personalizar el resultado. También añadí una condicional para que el resultado siempre salga en positivo, de esa manera no importa la diferencia de edades, el resultado siempre sera presentado en positivo
<meta charset="UTF-8">
<center>
<h2>Comparando Edades</h2>
<script>
function showme(msg){
document.write(msg)
}
var edad1=prompt("Ingresa tu Edad")
var edad2=prompt("Ingresa la Edad de tu hermano")
edades=edad1-edad2
if (edades<0)
{edades=edad2-edad1}
showme("La diferencia de edades es: " + edades + " años")
</script>
</center>
