[Sugerencia] Crea una función que reciba una lista de números y devuelva una nueva lista con el cuadrado de cada número.

const lista1 = [1,2,3];
const lista2 = [4,5,6];
const lista3 = [];

function suma (listas1,listas2){
    for (let i=0; i<lista1.length; i++){
            let llenado  = lista1[i]*listas1[i] ; 
             lista3.push(llenado); 
    }
    if (lista3.length == 3){
        for (let i=0; i<lista2.length; i++){

            let llenado2 = listas2[i] * listas2[i];
            lista3.push(llenado2);
           }

            
    }
     console.log(lista3); 
}

suma(lista1,lista2); 

// otra forma 
function cuadradoLista(lista) {
    return lista.map(num => num ** 2);
}

const lista = [2, 3, 4];
const resultado = cuadradoLista(lista);
console.log(resultado);