Mi solución fue que en el código la variable de la función for debía empezar en la posición 0 y no en 1, ya que Superman está en esta y por eso no lo muestra. Con esto se soluciona el ejercicio.
<meta charset="UTF-8">
<script>
var heroes = ["Superman", "Thor", "Batman", "Mujer Maravilla"];
for (var i = 0; i < heroes.length; i++) {
alert(heroes[i]);
}
</script>
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