El problema fue que en la inicialización puso posición inicial 1 y debería ser 0, como se muestra acontinuación:
<meta charset="UTF-8">
<script>
var heroes = ["Superman", "Thor", "Batman", "Mujer Maravilla"];
for( var i = 0; i < heroes.length; i++) {
alert(heroes[i]);
}
</script>