Aquí les dejo una alternativa a lo planteado
<meta charset="UTF-8">
<script>
function saltarLinea() {
document.write("<br>");
}
function imprimir(frase) {
document.write(frase);
saltarLinea();
}
var edad = parseInt(prompt("¿Cuál es tu edad?"));
//primero debemos asegurarnos de que tengan la mayoria de edad
if (edad >= 18) {
//posteriormente asegurarnos de que si tenga la licencia
var tieneLicencia = prompt("¿Tienes licencia? Responde S o N");
if (tieneLicencia == "S" || tieneLicencia == "s") {
imprimir("Puede Conducir");
}
if(tieneLicencia == "N" || tieneLicencia == "n"){
imprimir("No puede Conducir, porque no tiene licencia");
}
}else{
imprimir("No puede Conducir, porque no tiene la mayoría de edad");
}
</script>