habria que cambiar dos lineas de codigo el primero seria
let NumeroSecreto = Math.floor(Math.random() * 1000) + 1; que es donde esta generando el rango de numeros aleatorios
y el segundo seria:
NumeroDeUsuario = parseInt(prompt('Me indicas un numero del 1 al 1000: '));
que es eñ prompt dandole al usuario la informacion de que indique el numero del 1 al 1000