Buenas! Dejo mi solución. Cambié la opción de elegir "S" o "N" a minúsculas porque sino no me lo tomaba en el código. Si alguien sabe alguna solución para eso agradesco la info. Saludos!
<meta charset="UTF-8">
<h1>¿Puedo conducir?</h1>
<script>
    function saltarLinea() {
        document.write("<br>");
    }
    function imprimir(frase) {
        document.write(frase);
        saltarLinea();
    }
    var edad = parseInt(prompt("¿Cuál es tu edad?"));
    var tieneLicencia = prompt("¿Tienes licencia? Responde s (si) o n (no)");
if(edad >= 18){
    if(tieneLicencia == "s")
        imprimir("Usted está en regla, puede conducir.")
    else{
    imprimir("Usted tiene la edad legal para conducir. Ya puede comenzar los trámites para obtener su licencia de conducir.");
    }
}
else{
    imprimir("Usted aún no tiene la edad legal para conducir. Cuando cumpla los 18 años podrá comenzar los tramites para obetener su licencia de conducir.");
}
</script> 
             
            