Hice el código y agregué una condicional para que al colocar "s" minúscula la tome como válida
<meta charset="UTF-8">
<script>
function saltarLinea() {
document.write("<br>");
}
function imprimir(frase) {
document.write(frase);
saltarLinea();
}
var edad = parseInt(prompt("¿Cuál es tu edad?"));
var tieneLicencia = prompt("¿Tienes licencia? Responde S o N");
if ((edad >= 18) && (tieneLicencia = "S") && (tieneLicencia = "s")) {
imprimir("Puedes conducir");
}
else {
imprimir("No puedes conducir")
}
</script>