Solucionado
En el código que se da, el usuario debe escoger "S" o "N" según corresponda, pero en el caso de seleccionar "s", el resultado será "no puede conducir", ¿existe alguna forma que reconozca las respuestas sin importar si están en mayúsculas o minúsculas ?
Hola! Si, existe una forma, que sería convertir la cadena de texto (en este caso "s" o "n") a mayúsculas con la función toUpperCase(), quedando esa parte del código de la siguiente manera:
var tieneLicencia = prompt("¿Tienes licencia? Responde S o N").toUpperCase();
Leandro muchas gracias!