Hola Belen, como estás? espero que estés bien.
Sólo hice una observación, espero que te ayude.
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<h1>Recetas de Armando</h1>
<script>
    var ingredientes = [];
    var cantidad = parseInt(prompt("¿Cuántos ingredientes vas a añadir?"));
    var contador = 1;
    while( contador <= cantidad) {
        var ingrediente = prompt("Informe el ingrediente " + contador);
        var encontrado = false;
        for (var posicion = 0; posicion < ingredientes.length; posicion++){
            if (ingrediente == ingredientes[posicion]) {
                encontrado = true;
                  alert("repetido " + ingrediente); // Necesitaba declarar la "alerta" con la información de que hay un ingrediente repetido y cuál es ese ingrediente.
                break;
            }
        }
        if (encontrado == false) {
            ingredientes.push(ingrediente);
            contador++;
        }
    }
    console.log(ingredientes);
</script>
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