function saltarLinea() {
document.write("<br>");
}
function imprimir(frase) {
document.write(frase);
saltarLinea();
}
var edad = parseInt(prompt("¿Cuál es tu edad?"));
var tieneLicencia = prompt("¿Tienes licencia? Responde S o N");
if (edad > 17 && tieneLicencia == ("S" || "s")) {
imprimir("Puedes conducir");
} else {
imprimir("No puedes conducir");
}
Muy buen desarrollo que te parece si validamos que al no cumplir la edad ya no preguntamos si tiene licencia y además el mensaje de "no puedes conducir lo dejamos mas global dependiendo del valor de ambas respuestas. También para que el código sea mas legible comparamos el valor de tiene licencia con cada una de las posibilidades separadamente.