Para que realice la verificacion es necesario utilizar condicionales que permitan la verificacion de los datos
var edad = parseInt(prompt("Ingrese su edad")); var licencia = prompt("Tiene licencia?, Responder S o N ");
if (edad >= 18 ){
if( licencia == "S"){
alert("Puede conducir");
}
}else{
alert("No puede conducir");
}