por que cuando le aplicas estilos css a la lista (ul) se desordena lo que ya habia aplicado?

Hola, recuerda que CSS aplica los estilos en cascada, es decir, a medida que va leyendo el código, es posible que (por suponer) aplicaste un estilo al elemento ul en la primera mitad del código, pero luego volviste a aplicar estilos a la lista pero esta vez usando la clase, si es el caso, el navegador reemplazará los estilos que habías aplicado al elemento ul por los que aplicaste usando la clase. Espero sirva de ayuda, saludos.

Los estilos de la lista los estas aplicando a la lista per se o a los elementos hijos?

concuerdo con Sebastian al momento de aplicar al css debes de llamar bien al elemento en ese caso es un elemento hijo posiblemente

Muchas gracias ya resolví ese era el problema..