En los arreglos el índice inicia desde 0, por lo que en el arreglo de "heroes"
var heroes = ["Superman", "Thor", "Batman", "Mujer Maravilla"];
for( var i = 1; i < heroes.length; i++) {
alert(heroes[i]);
}Al for iniciar en 1, obvia el primer elemento del arreglo, ignorando a Superman
La correccion seria iniciar el for con i = 0
for( var i = 0; i < heroes.length; i++) {
alert(heroes[i]);
}