Otra manera de hacerlo agregando un evento, también añadí la función de limpiar el input
<!DOCTYPE html>
<html lang="en">
<head>
<meta charset="UTF-8">
<meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=edge">
<meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0">
<title>Numero Secreto</title>
</head>
<body>
<h2>Adivinar el numero pensado</h2>
<input type="text">
<button>Verificar si acerto</button>
</body>
<script>
var Secreto = 5;
var inputfocused = "";
var input = document.querySelector("input");
function verificar() {
if (parseInt(input.value) == Secreto) {
alert("Acertaste");
} else {
alert("Fallaste");
}
}
function limpiar() {
input.value = "";
}
document.querySelector("button").addEventListener("click", verificar);
document.querySelector("button").addEventListener("click", limpiar);
</script>
</html>