¡Hola, Julio!
Las dos carpetas con las que está trabajando necesitan tener el archivo .git.
En la carpeta del servidor, por ejemplo, no es capaz de identificarla.
Recomiendo hacer el paso a paso nuevamente para entender el orden de los comandos y fijarlos mejor.
Cuanto más practiques, más fácil será el uso de la herramienta.
Abrazos!