Hola! Lo que te aparece en el archivo descargado es a lo que llegan los instructores al finalizar la clase. Ellos van explicando el paso a paso, por eso que lo 1ero que muestran es el archivo app.js vacío, y a medida que avanza la clase van escribiendo el código hasta llegar a lo que te aparece en el archivo descargado. Tú verás si es que te resulta más fácil aprender partiendo de cero (borrando todo y escribiendo el código a la par con la clase) o ir entendiendo cada línea de código ya escrita en el archivo a medida que los instructores lo van explicando.