NO ENCUENTRO EL ERROR

He revisado tu código y parece que el problema se encuentra en la función verificar(). En el bucle for dentro de esta función, estás usando vueltas como el límite del bucle, pero vueltas no está definido en ningún lugar, lo cual podría causar un error y hacer que siempre muestre "No acertó" incluso si el número es adivinado correctamente. Para solucionar esto, puedes usar secreto.length como el límite del bucle, ya que secreto es el arreglo que contiene los números secretos generados.

Aquí está el código corregido:

<meta charset="UTF-8">

<input> </input>

<button>Verificar si acertó adivinando 4</button>

<script>

    function generadorAleatorio (){ 

        return Math.round(Math.random()*10); 

    }   


    function sortearNumeros (cantidad){  
        var secretosNum = [];    
        var contador = 1;    

        while (contador <= cantidad){   

            var numeroAleatorio = generadorAleatorio();
            console.log(numeroAleatorio)
            var encontrado = false;

            if (numeroAleatorio != 0) { 

                for (var posicion = 0; posicion <= secretosNum.length; posicion++) {

                    if (numeroAleatorio == secretosNum [posicion]){
                    encontrado = true;
                    break;

                    }

                }

                if (encontrado == false){ 

                    secretosNum.push(numeroAleatorio);  
                    contador++; 

                }                                              

            }

        }

        return secretosNum

    }

    var secreto = sortearNumeros(4);   
    console.log(secreto);             

    var input = document.querySelector("input");
    input.focus();

    var button = document.querySelector("button");

    function verificar(){

        var adivinado = false;

        for (var vueltas = 0; vueltas < secreto.length ; vueltas++) { 

            if (parseInt(input.value) == secreto[vueltas]) {

                alert("Usted acertó la adivinanza!!");
                adivinado = true; 
                break; 
            } 

        }

        if (adivinado == false) {

             alert("No acertó"); 

        }

        input.value = "";

        input.focus();

    }

    button.onclick = verificar;

</script>

Efectivamente el error era igualar mi contador vueltas consigo mismo jajaj, nunca iva a pasar nada asi!!.

CODIGO CON ERROR:
VUELTAS = VUELTAS

for (var vueltas = 0; vueltas < vueltas.length ; vueltas++) { 

            if (parseInt(input.value) == secreto[vueltas]) {

                alert("Usted acerto la adivinanza!!");
                adivinado = true; 
                break; 
            } 

//--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
CODIGO CORREGIDO:

for (var vuelta = 0; vuelta < secreto.length ; vuelta++) { 

            if (parseInt(input.value) == secreto[vuelta]) {

                alert("Usted acerto la adivinanza!!");
                adivinado = true; 
                break; 
            }