Si ya tenias la tabla de pacientes creada y quieres agregar campos, entonces deberías crear un nuevo archivo para la migración, y colocar dentro un alter table tal que asi: ALTER TABLE table_name ADD column_name datatype;
Ejemplo:
Si tienes un V2__create-table-pacientes.sql, y quieres agregar mas campos crea un nuevo archivo V3__alter-table-pacientes.sql, y dentro:
alter table pacientes add urbanizacion varchar(100), codigo_postal varchar(100) not null, 'demás campos' ;
Ahora, al parecer tienes un error en la migración V3, quizá por lo anterior. Prueba borrando esa migración en tu base de datos,
busca la tabla flyway_schema_history y elimina la ultima migración que hiciste (la V3). Si el error persiste prueba borrando también tu tabla pacientes.
Espero que esto ayude a resolver tu problema.