Mejoremos el codigo

Hola, te propongo una solucion un poco mas limpia:

<script>
        var ingredientes = [];
        var cantidad = parseInt(prompt("¿Cuantos ingredientes va a añadir?"));
        var contador = 1;

        for(var i=0; i<cantidad; i++){
            var ingrediente = prompt("Informe el ingrediente " + contador);
            while(ingredientes.includes(ingrediente.toLowerCase())){
                alert("El ingrediente ya se ha añadido a la lista");
                ingrediente = prompt("Informe el ingrediente " + contador);
            }
            ingredientes.push(ingrediente.toLowerCase());
            contador++;
        }

        console.log(ingredientes);
    </script>

Espero te sirva de ayuda como caso de estudio! Saludos!!!