me queda en loop mi codigo, ayuda !

Dentro de tu codigo faltaron acomodar correctamente las variables, ademas de un return

Te dejo en el codigo como comentario donde faltaron :)

<meta charset="utf-8">

<input/>
<button> Verificar si acertó con el secreto</button>

<script> 
    function aleatorio() {
        // Debe llevar el return, para que retorne el valor obtenido
        return Math.round(Math.random()*10);
    } 

    function sortearNumeros(cantidad) {

        var secretos = [];
        var contador = 1;

        while(contador <= cantidad) {
            var numeroAleatorio = aleatorio();
            console.log(numeroAleatorio);
            var encontrado = false;

            if(numeroAleatorio != 0) {
                for(var posicion = 0; posicion < secretos.length; posicion++) {
                    if (numeroAleatorio == secretos[posicion]) {
                        // Debe ser igualdad con dos simbolos ==
                        encontrado == true;
                        break;
                    }
                }
                if (encontrado == false) {
                    secretos.push(numeroAleatorio);
                    contador++;
                }
            }
        }
        return secretos;
    }

    var secretos = sortearNumeros(4);
    console.log(secretos);

    var input = document.querySelector("input");
    input.focus();

    function verificar() {
        // Debe ir dentro de la funcion 
        var encontrado = false;

        for (var posicion = 0; posicion < secretos.length; posicion++) {
            if(parseInt(input.value) == secretos[posicion]) {
                alert("Usted acertó");
                encontrado = true;
                break;
            }
        }    

        if(encontrado == false) {
            alert("Usted erró");
        }
        input.value= ("");
        input.focus();
    }

    var button =document.querySelector("button");
    button.onclick = verificar;

</script>

Gracias por compartir el código me ayudo a encontrar lo que estaba fallando, pero tengo una observación

if(numeroAleatorio != 0) { for(var posicion = 0; posicion < secretos.length; posicion++) { if (numeroAleatorio == secretos[posicion]) { // Debe ser igualdad con dos simbolos == encontrado == true; break; } }

esta incorrecto la parte de encontrado == true la sintaxis correcta es encontrado = true; ya que le estás asignado el valor true no igualándolo 

Ya al final del curso se fue como hilo de media y me perdí XD