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Hola Marcos, espero que estés bien!
Sí, es posible tener más de un canva en HTML. En especial, en HTML5 es posible tener más de uno con una eficiencia buena, sin pérdidas de perfomance.
Algunas fuentes hasta incentivan el uso de más de uno, pero creo que es conforme a su necesidad, ¿correcto? Lo que es necesario para su actividad.
Saludos y buenos estudios!