¡Hola Gregory!
Un archivo MSI (Microsoft Installer) es un tipo de archivo de instalación utilizado en sistemas operativos Windows. Este tipo de archivo se utiliza para instalar software en el sistema operativo Windows.
Por otro lado, un archivo .installer puede ser cualquier tipo de archivo de instalación utilizado en diferentes sistemas operativos. Por ejemplo, en sistemas operativos Linux, los archivos de instalación suelen tener la extensión .deb o .rpm.
En resumen, la principal diferencia entre un archivo MSI y un archivo .installer es que el primero se utiliza específicamente en sistemas operativos Windows, mientras que el segundo puede ser utilizado en diferentes sistemas operativos.
Espero que esta respuesta haya aclarado tu duda. ¡Buenos estudios!