Buenas noches Pedro!
Funciona como en html, al estar entre <> interpreta el br como una etiqueta.
Para que sea sólo parte del string podrías reemplazar los signos por: < *y *>.
<!DOCTYPE html>
<html lang="en">
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<meta charset="UTF-8">
<meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=edge">
<meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0">
<title>Document</title>
</head>
<body>
<h3>¿Alcohol o gasolina?</h3>
</body>
<script>
var tanque = 40;
var total_km = 480;
var consumoGasolina = total_km/tanque;
document.write("El consumo de gasolina es de " + consumoGasolina + " KM/L.<br>");
var total_km = 300;
var consumoAlcohol = total_km/tanque;
document.write("El consumo de alcohol es de " + consumoAlcohol + " KM/L.<br>");
document.write("El consumo de alcohol es de " + consumoAlcohol + " KM/L. < br >");
</script>
</html>