Hola, tu codigo esta bien, solo tienes un pequeño detalle, recuerda que la funcion alert debe ir dentro del script.
<script>
alert("Ejercicio de diferencia de edades");
</script>
<meta charset="UTF-8">
<h1>¿Cuántos años de diferencia hay entre mi hermano y yo?</h1>
<script>
alert("Ejercicio de diferencia de edades");
function lineJump() {
document.write("<br>");
document.write("<br>");
}
function print(message) {
document.write(message);
lineJump();
}
var age1 = 25;
var age2 = 42;
var ageDifference = age1 - age2;
print(" La edad de mi hermano es " + age1 + " años");
print(" Mi edad es " + age2 + " años");
print(" La diferencia de edades es " + ageDifference + " años");
</script>