Después de ver algunos tópicos del foro, lo que ayudo bastante, hice algunas modificaciones al código, lo comparto
<meta charset="UTF-8">
<script>
function saltarLinea() {
document.write("<br>");
};
function imprimir(frase) {
saltarLinea();
document.write(frase);
saltarLinea();
};
var edad = parseInt(prompt("¿Cuál es tu edad?"));
if (edad >= 18) {
var tieneLicencia = prompt("¿Tienes licencia? Responde S o N");
if (tieneLicencia =='s' || tieneLicencia =='S') {
imprimir('Puede conducir');
} else { imprimir ('No puede conducir, le falta la licencia');};
};
if (edad < 18) {imprimir('No tiene edad legal para conducir');};
</script>
