Excelente uso, yo acabo de realizar este ejercicio tambien, en mi caso implemente una funcion para hacer que la diferencia siempre sea positiva
function calcula(edad1,edad2){
resultado = edad1-edad2
if (resultado<0) {
resultado = resultado * -1
document.write("La diferencia de edades es: ",resultado)
}
else{
document.write("La diferencia de edades es: ",resultado)
}
}