Buenas noches, no se si estoy mal, pero no veo que hayas publicado tu codigo

<meta charset="UTF-8">

<h1>JUEGO PENSADO</h1>

<script>

    function saltarlinea() {
        document.write("<br>");
        document.write("<br>");

    }

    function imprimir(frase) {
    document.write(frase);
    saltarlinea();

    }

    var numeroPensado = 5;
    var numeroLanzado = parseInt(prompt("Ingrese un número entre 0-10"))

    if (numeroPensado == numeroLanzado) {

        imprimir("usted acertó")

    }

    if(numeroPensado) != (numeroLanzado) {

        imprimir("usted erró, el número pensado era " + numeroPensado)
    }

Creo que tengo el mismo error... no me aparece el pop-up.

En la consola me aparece este error

caught SyntaxError: Unexpected token '!=' (

Tienes un error con los parentesis en el último if

 if(numeroPensado) != (numeroLanzado) {

        imprimir("usted erró, el número pensado era " + numeroPensado)
    }

Debería ser así

 if(numeroPensado != numeroLanzado) {

        imprimir("usted erró, el número pensado era " + numeroPensado)
    }